Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfaP48030 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TgfaP48030 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TgfaP48030 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TgfaP48030 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TgfaP48030 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TgfaP48030 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms