Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg3P47867 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg3P47867 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg3P47867 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg3P47867 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Scg3P47867 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg3P47867 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg3P47867 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg3P47867 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg3P47867 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg3P47867 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg3P47867 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg3P47867 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms