Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SrprbP47758 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SrprbP47758 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrprbP47758 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrprbP47758 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrprbP47758 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms