Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf1P46099 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf1P46099 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf1P46099 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf1P46099 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf1P46099 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klf1P46099 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms