Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms