Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms