Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NodalP43021 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NodalP43021 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NodalP43021 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NodalP43021 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NodalP43021 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NodalP43021 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NodalP43021 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NodalP43021 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NodalP43021 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NodalP43021 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NodalP43021 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NodalP43021 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NodalP43021 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NodalP43021 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NodalP43021 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NodalP43021 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NodalP43021 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NodalP43021 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NodalP43021 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NodalP43021 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NodalP43021 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NodalP43021 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NodalP43021 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NodalP43021 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NodalP43021 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NodalP43021 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NodalP43021 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NodalP43021 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NodalP43021 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NodalP43021 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NodalP43021 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NodalP43021 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NodalP43021 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NodalP43021 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NodalP43021 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NodalP43021 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NodalP43021 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NodalP43021 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NodalP43021 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NodalP43021 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NodalP43021 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NodalP43021 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NodalP43021 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NodalP43021 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NodalP43021 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NodalP43021 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NodalP43021 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NodalP43021 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NodalP43021 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NodalP43021 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NodalP43021 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NodalP43021 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NodalP43021 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NodalP43021 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NodalP43021 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NodalP43021 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NodalP43021 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NodalP43021 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NodalP43021 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NodalP43021 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NodalP43021 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NodalP43021 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NodalP43021 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NodalP43021 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NodalP43021 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms