Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms