Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Nkx1-2P42580 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkx1-2P42580 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkx1-2P42580 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkx1-2P42580 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkx1-2P42580 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkx1-2P42580 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkx1-2P42580 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkx1-2P42580 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkx1-2P42580 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkx1-2P42580 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkx1-2P42580 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkx1-2P42580 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkx1-2P42580 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkx1-2P42580 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkx1-2P42580 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkx1-2P42580 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkx1-2P42580 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nkx1-2P42580 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nkx1-2P42580 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nkx1-2P42580 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nkx1-2P42580 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nkx1-2P42580 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nkx1-2P42580 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nkx1-2P42580 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nkx1-2P42580 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Nkx1-2P42580 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nkx1-2P42580 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nkx1-2P42580 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nkx1-2P42580 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nkx1-2P42580 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nkx1-2P42580 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nkx1-2P42580 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nkx1-2P42580 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nkx1-2P42580 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms