Protein–RNA interactions for Protein: P40749

Syt4, Synaptotagmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt4P40749 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt4P40749 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt4P40749 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt4P40749 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt4P40749 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt4P40749 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt4P40749 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt4P40749 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt4P40749 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt4P40749 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt4P40749 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt4P40749 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms