Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms