Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TtlP38585 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TtlP38585 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TtlP38585 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TtlP38585 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TtlP38585 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TtlP38585 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TtlP38585 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TtlP38585 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TtlP38585 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TtlP38585 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TtlP38585 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TtlP38585 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TtlP38585 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TtlP38585 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TtlP38585 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TtlP38585 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtlP38585 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtlP38585 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtlP38585 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtlP38585 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtlP38585 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtlP38585 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtlP38585 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtlP38585 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtlP38585 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtlP38585 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TtlP38585 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtlP38585 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtlP38585 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtlP38585 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtlP38585 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtlP38585 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtlP38585 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtlP38585 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtlP38585 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtlP38585 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtlP38585 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtlP38585 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtlP38585 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtlP38585 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtlP38585 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtlP38585 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtlP38585 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtlP38585 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtlP38585 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TtlP38585 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TtlP38585 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TtlP38585 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TtlP38585 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TtlP38585 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TtlP38585 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TtlP38585 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TtlP38585 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TtlP38585 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TtlP38585 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TtlP38585 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TtlP38585 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TtlP38585 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TtlP38585 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TtlP38585 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TtlP38585 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TtlP38585 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TtlP38585 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TtlP38585 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TtlP38585 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TtlP38585 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TtlP38585 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TtlP38585 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TtlP38585 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TtlP38585 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TtlP38585 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TtlP38585 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TtlP38585 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TtlP38585 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TtlP38585 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TtlP38585 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TtlP38585 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TtlP38585 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TtlP38585 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TtlP38585 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TtlP38585 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TtlP38585 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TtlP38585 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TtlP38585 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TtlP38585 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TtlP38585 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TtlP38585 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TtlP38585 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TtlP38585 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TtlP38585 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TtlP38585 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TtlP38585 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TtlP38585 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TtlP38585 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TtlP38585 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TtlP38585 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TtlP38585 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TtlP38585 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TtlP38585 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms