Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms