Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprkP35822 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprkP35822 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprkP35822 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprkP35822 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprkP35822 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprkP35822 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprkP35822 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprkP35822 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PtprkP35822 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms