Protein–RNA interactions for Protein: P35546

Ret, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, mousemouse

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetP35546 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RetP35546 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RetP35546 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RetP35546 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RetP35546 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RetP35546 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RetP35546 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RetP35546 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RetP35546 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RetP35546 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RetP35546 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RetP35546 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RetP35546 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RetP35546 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RetP35546 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RetP35546 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RetP35546 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RetP35546 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RetP35546 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RetP35546 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RetP35546 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RetP35546 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RetP35546 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RetP35546 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RetP35546 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RetP35546 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RetP35546 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RetP35546 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RetP35546 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RetP35546 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RetP35546 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RetP35546 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RetP35546 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RetP35546 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RetP35546 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RetP35546 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RetP35546 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RetP35546 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RetP35546 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RetP35546 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RetP35546 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RetP35546 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RetP35546 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RetP35546 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RetP35546 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RetP35546 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RetP35546 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RetP35546 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RetP35546 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RetP35546 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RetP35546 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RetP35546 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RetP35546 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RetP35546 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RetP35546 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RetP35546 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RetP35546 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RetP35546 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RetP35546 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RetP35546 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RetP35546 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RetP35546 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RetP35546 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RetP35546 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RetP35546 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RetP35546 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RetP35546 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RetP35546 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RetP35546 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RetP35546 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RetP35546 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RetP35546 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RetP35546 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RetP35546 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RetP35546 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RetP35546 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RetP35546 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RetP35546 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RetP35546 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RetP35546 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RetP35546 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RetP35546 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RetP35546 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RetP35546 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RetP35546 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RetP35546 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RetP35546 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RetP35546 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RetP35546 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RetP35546 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RetP35546 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RetP35546 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RetP35546 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RetP35546 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RetP35546 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RetP35546 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RetP35546 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RetP35546 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RetP35546 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RetP35546 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms