Protein–RNA interactions for Protein: P35460

Ly6f, Lymphocyte antigen 6F, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6fP35460 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6fP35460 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms