Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ly6dP35459 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms