Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin1P35438 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin1P35438 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Grin1P35438 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin1P35438 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin1P35438 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin1P35438 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin1P35438 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin1P35438 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms