Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp4P35123 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp4P35123 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp4P35123 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp4P35123 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp4P35123 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms