Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp12P34960 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms