Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SsbP32067 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SsbP32067 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SsbP32067 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SsbP32067 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SsbP32067 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SsbP32067 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SsbP32067 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SsbP32067 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SsbP32067 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SsbP32067 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SsbP32067 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SsbP32067 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SsbP32067 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SsbP32067 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SsbP32067 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SsbP32067 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SsbP32067 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SsbP32067 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SsbP32067 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SsbP32067 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SsbP32067 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SsbP32067 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SsbP32067 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SsbP32067 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SsbP32067 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SsbP32067 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SsbP32067 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SsbP32067 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SsbP32067 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SsbP32067 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SsbP32067 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SsbP32067 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SsbP32067 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SsbP32067 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SsbP32067 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SsbP32067 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SsbP32067 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SsbP32067 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SsbP32067 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SsbP32067 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SsbP32067 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SsbP32067 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SsbP32067 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SsbP32067 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SsbP32067 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SsbP32067 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SsbP32067 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SsbP32067 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SsbP32067 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SsbP32067 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SsbP32067 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SsbP32067 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SsbP32067 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SsbP32067 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SsbP32067 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SsbP32067 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SsbP32067 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SsbP32067 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SsbP32067 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SsbP32067 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SsbP32067 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SsbP32067 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SsbP32067 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SsbP32067 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SsbP32067 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SsbP32067 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SsbP32067 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SsbP32067 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SsbP32067 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SsbP32067 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SsbP32067 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SsbP32067 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SsbP32067 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SsbP32067 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SsbP32067 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SsbP32067 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SsbP32067 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SsbP32067 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SsbP32067 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SsbP32067 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SsbP32067 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SsbP32067 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SsbP32067 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SsbP32067 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SsbP32067 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SsbP32067 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SsbP32067 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SsbP32067 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SsbP32067 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SsbP32067 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SsbP32067 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SsbP32067 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SsbP32067 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SsbP32067 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SsbP32067 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SsbP32067 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SsbP32067 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SsbP32067 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SsbP32067 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms