Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Notch4P31695 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Notch4P31695 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Notch4P31695 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Notch4P31695 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Notch4P31695 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Notch4P31695 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Notch4P31695 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms