Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Saa4P31532 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Saa4P31532 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Saa4P31532 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Saa4P31532 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Saa4P31532 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Saa4P31532 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Saa4P31532 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Saa4P31532 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Saa4P31532 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Saa4P31532 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Saa4P31532 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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