Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ctnnd1P30999 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms