Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VtnP29788 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VtnP29788 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VtnP29788 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VtnP29788 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VtnP29788 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VtnP29788 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VtnP29788 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VtnP29788 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VtnP29788 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VtnP29788 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VtnP29788 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VtnP29788 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VtnP29788 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VtnP29788 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VtnP29788 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VtnP29788 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VtnP29788 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VtnP29788 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VtnP29788 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
VtnP29788 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VtnP29788 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VtnP29788 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VtnP29788 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VtnP29788 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VtnP29788 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VtnP29788 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VtnP29788 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VtnP29788 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VtnP29788 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VtnP29788 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VtnP29788 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VtnP29788 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VtnP29788 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VtnP29788 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VtnP29788 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VtnP29788 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VtnP29788 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VtnP29788 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VtnP29788 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VtnP29788 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VtnP29788 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VtnP29788 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VtnP29788 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VtnP29788 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VtnP29788 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VtnP29788 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VtnP29788 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VtnP29788 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VtnP29788 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VtnP29788 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VtnP29788 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VtnP29788 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VtnP29788 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VtnP29788 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VtnP29788 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VtnP29788 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VtnP29788 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VtnP29788 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VtnP29788 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VtnP29788 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VtnP29788 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VtnP29788 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VtnP29788 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VtnP29788 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VtnP29788 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VtnP29788 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VtnP29788 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VtnP29788 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VtnP29788 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VtnP29788 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VtnP29788 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VtnP29788 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VtnP29788 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VtnP29788 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VtnP29788 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VtnP29788 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VtnP29788 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VtnP29788 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VtnP29788 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VtnP29788 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VtnP29788 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VtnP29788 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VtnP29788 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VtnP29788 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VtnP29788 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VtnP29788 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VtnP29788 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VtnP29788 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VtnP29788 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VtnP29788 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VtnP29788 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VtnP29788 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VtnP29788 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VtnP29788 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VtnP29788 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VtnP29788 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VtnP29788 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VtnP29788 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VtnP29788 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms