Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pabpc1P29341 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms