Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxraP28700 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxraP28700 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxraP28700 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxraP28700 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxraP28700 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxraP28700 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxraP28700 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxraP28700 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxraP28700 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxraP28700 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxraP28700 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxraP28700 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RxraP28700 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxraP28700 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxraP28700 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxraP28700 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxraP28700 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxraP28700 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxraP28700 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RxraP28700 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxraP28700 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxraP28700 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxraP28700 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxraP28700 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxraP28700 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxraP28700 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RxraP28700 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxraP28700 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxraP28700 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxraP28700 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RxraP28700 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RxraP28700 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RxraP28700 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RxraP28700 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RxraP28700 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RxraP28700 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RxraP28700 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RxraP28700 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RxraP28700 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RxraP28700 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RxraP28700 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RxraP28700 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RxraP28700 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RxraP28700 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RxraP28700 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RxraP28700 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RxraP28700 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RxraP28700 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RxraP28700 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RxraP28700 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RxraP28700 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RxraP28700 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RxraP28700 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxraP28700 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxraP28700 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxraP28700 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxraP28700 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxraP28700 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxraP28700 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RxraP28700 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxraP28700 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxraP28700 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxraP28700 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxraP28700 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxraP28700 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxraP28700 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxraP28700 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RxraP28700 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RxraP28700 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RxraP28700 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RxraP28700 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RxraP28700 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RxraP28700 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RxraP28700 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RxraP28700 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RxraP28700 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RxraP28700 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RxraP28700 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RxraP28700 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RxraP28700 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RxraP28700 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RxraP28700 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RxraP28700 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RxraP28700 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RxraP28700 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxraP28700 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxraP28700 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxraP28700 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxraP28700 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxraP28700 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxraP28700 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RxraP28700 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RxraP28700 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RxraP28700 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxraP28700 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxraP28700 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxraP28700 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxraP28700 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxraP28700 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms