Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BgnP28653 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BgnP28653 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BgnP28653 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BgnP28653 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BgnP28653 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BgnP28653 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BgnP28653 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BgnP28653 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BgnP28653 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BgnP28653 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BgnP28653 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BgnP28653 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BgnP28653 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BgnP28653 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BgnP28653 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BgnP28653 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BgnP28653 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BgnP28653 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BgnP28653 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BgnP28653 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BgnP28653 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BgnP28653 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BgnP28653 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BgnP28653 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BgnP28653 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BgnP28653 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BgnP28653 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BgnP28653 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BgnP28653 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BgnP28653 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BgnP28653 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BgnP28653 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BgnP28653 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BgnP28653 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BgnP28653 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BgnP28653 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BgnP28653 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BgnP28653 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BgnP28653 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BgnP28653 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BgnP28653 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BgnP28653 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BgnP28653 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BgnP28653 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BgnP28653 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BgnP28653 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BgnP28653 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BgnP28653 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BgnP28653 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BgnP28653 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BgnP28653 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BgnP28653 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BgnP28653 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BgnP28653 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BgnP28653 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BgnP28653 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BgnP28653 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BgnP28653 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BgnP28653 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BgnP28653 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BgnP28653 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BgnP28653 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BgnP28653 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BgnP28653 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BgnP28653 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BgnP28653 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BgnP28653 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BgnP28653 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BgnP28653 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BgnP28653 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BgnP28653 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BgnP28653 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BgnP28653 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BgnP28653 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BgnP28653 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BgnP28653 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BgnP28653 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BgnP28653 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BgnP28653 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BgnP28653 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BgnP28653 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BgnP28653 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BgnP28653 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BgnP28653 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BgnP28653 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BgnP28653 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BgnP28653 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BgnP28653 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BgnP28653 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BgnP28653 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BgnP28653 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BgnP28653 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BgnP28653 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BgnP28653 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BgnP28653 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BgnP28653 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BgnP28653 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BgnP28653 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BgnP28653 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms