Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxd10P28359 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxd10P28359 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd10P28359 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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