Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms