Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-DMaP28078 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms