Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3P27659 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms