Protein–RNA interactions for Protein: P27512

Cd40, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 5, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40P27512 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40P27512 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40P27512 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd40P27512 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd40P27512 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd40P27512 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd40P27512 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms