Protein–RNA interactions for Protein: P25976

Ubtf, Nucleolar transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbtfP25976 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UbtfP25976 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UbtfP25976 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UbtfP25976 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UbtfP25976 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UbtfP25976 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UbtfP25976 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UbtfP25976 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms