Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou2f1P25425 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou2f1P25425 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou2f1P25425 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou2f1P25425 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou2f1P25425 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou2f1P25425 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou2f1P25425 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou2f1P25425 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou2f1P25425 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou2f1P25425 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou2f1P25425 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou2f1P25425 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou2f1P25425 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou2f1P25425 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou2f1P25425 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou2f1P25425 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou2f1P25425 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou2f1P25425 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou2f1P25425 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou2f1P25425 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms