Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria1P23818 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria1P23818 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria1P23818 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria1P23818 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria1P23818 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria1P23818 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria1P23818 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria1P23818 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms