Protein–RNA interactions for Protein: P23299

Kcne1, Potassium voltage-gated channel subfamily E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcne1P23299 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcne1P23299 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms