Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja1P23242 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja1P23242 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja1P23242 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja1P23242 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja1P23242 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja1P23242 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja1P23242 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms