Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tpm3P21107 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpm3P21107 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpm3P21107 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpm3P21107 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpm3P21107 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpm3P21107 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpm3P21107 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpm3P21107 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpm3P21107 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpm3P21107 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpm3P21107 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpm3P21107 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpm3P21107 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpm3P21107 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpm3P21107 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpm3P21107 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpm3P21107 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm3P21107 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm3P21107 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm3P21107 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm3P21107 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm3P21107 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm3P21107 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm3P21107 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm3P21107 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm3P21107 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm3P21107 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm3P21107 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm3P21107 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpm3P21107 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpm3P21107 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpm3P21107 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpm3P21107 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpm3P21107 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms