Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms