Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prim1P20664 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prim1P20664 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prim1P20664 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prim1P20664 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prim1P20664 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prim1P20664 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prim1P20664 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prim1P20664 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prim1P20664 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prim1P20664 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prim1P20664 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Prim1P20664 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms