Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fcer1aP20489 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms