Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfaP20033 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PdgfaP20033 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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