Protein–RNA interactions for Protein: P19785

Esr1, Estrogen receptor, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esr1P19785 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Esr1P19785 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Esr1P19785 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Esr1P19785 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Esr1P19785 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Esr1P19785 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Esr1P19785 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Esr1P19785 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Esr1P19785 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Esr1P19785 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Esr1P19785 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms