Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

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Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NefhP19246 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NefhP19246 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NefhP19246 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NefhP19246 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NefhP19246 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NefhP19246 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NefhP19246 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NefhP19246 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NefhP19246 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NefhP19246 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NefhP19246 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NefhP19246 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NefhP19246 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NefhP19246 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NefhP19246 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NefhP19246 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NefhP19246 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NefhP19246 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NefhP19246 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NefhP19246 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NefhP19246 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NefhP19246 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NefhP19246 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NefhP19246 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NefhP19246 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NefhP19246 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NefhP19246 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NefhP19246 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NefhP19246 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NefhP19246 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NefhP19246 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NefhP19246 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NefhP19246 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NefhP19246 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NefhP19246 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NefhP19246 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NefhP19246 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NefhP19246 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NefhP19246 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NefhP19246 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NefhP19246 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NefhP19246 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NefhP19246 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NefhP19246 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NefhP19246 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NefhP19246 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NefhP19246 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NefhP19246 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NefhP19246 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NefhP19246 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NefhP19246 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NefhP19246 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NefhP19246 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NefhP19246 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NefhP19246 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NefhP19246 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NefhP19246 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NefhP19246 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NefhP19246 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NefhP19246 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NefhP19246 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NefhP19246 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NefhP19246 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NefhP19246 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NefhP19246 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NefhP19246 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NefhP19246 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NefhP19246 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NefhP19246 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NefhP19246 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NefhP19246 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NefhP19246 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NefhP19246 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NefhP19246 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NefhP19246 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NefhP19246 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NefhP19246 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NefhP19246 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NefhP19246 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NefhP19246 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NefhP19246 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NefhP19246 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NefhP19246 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NefhP19246 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NefhP19246 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NefhP19246 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NefhP19246 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NefhP19246 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NefhP19246 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NefhP19246 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NefhP19246 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NefhP19246 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NefhP19246 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NefhP19246 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NefhP19246 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NefhP19246 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NefhP19246 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NefhP19246 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NefhP19246 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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