Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifrd1P19182 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms