Protein–RNA interactions for Protein: P18608

Hmgn1, Non-histone chromosomal protein HMG-14, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn1P18608 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgn1P18608 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms