Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18533 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18533 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18533 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18533 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18533 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18533 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18533 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18533 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18533 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18533 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18533 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18533 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18533 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18533 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18533 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18533 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18533 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18533 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18533 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18533 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18533 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18533 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18533 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P18533 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18533 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18533 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18533 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18533 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18533 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18533 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P18533 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18533 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18533 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18533 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18533 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18533 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18533 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18533 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18533 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18533 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18533 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18533 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18533 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18533 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P18533 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18533 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18533 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18533 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18533 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18533 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18533 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18533 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18533 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18533 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P18533 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18533 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18533 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18533 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18533 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18533 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18533 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18533 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18533 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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P18533 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18533 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18533 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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P18533 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18533 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18533 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18533 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18533 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P18533 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18533 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P18533 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18533 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18533 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18533 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18533 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18533 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18533 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P18533 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P18533 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P18533 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18533 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18533 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18533 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P18533 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18533 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18533 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18533 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18533 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18533 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms