Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcnaP17918 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcnaP17918 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PcnaP17918 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PcnaP17918 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PcnaP17918 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PcnaP17918 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms