Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabra6P16305 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra6P16305 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms